天津医药 ›› 2015, Vol. 43 ›› Issue (10): 1108-1111.doi: 10.11958/j.issn.0253-9896.2015.10.006
摘要:
摘要: 目的 筛选影响卵巢癌顺铂耐药性的靶点基因。方法 从 GEO 数据库中下载对顺铂敏感和产生抗药性
的人类卵巢癌细胞基因表达谱和甲基化谱数据(GSE15709), 利用 R 的相关工具包筛选 A2780 和 A2780/DDP(顺铂
耐药卵巢癌细胞系)两类卵巢癌细胞之间的差异表达和差异甲基化的基因; 使用 DAVID 数据库对差异表达基因进
行功能富集分析; 对同时发生了差异甲基化、 差异表达且甲基化水平、 表达水平的变化趋势相反的基因, 进一步利用
qRT-PCR 技术检测这些基因在两种卵巢癌细胞中的表达值。结果 研究发现在两种卵巢癌细胞之间发生了 416 个
差异表达和 281 个差异甲基化的基因, 这些差异表达基因主要富集于细胞周期、 核分裂和蛋白修饰负调控等生物过
程。此外, 细胞周期、 DNA 复制和 p53 等通路在这些基因中同样富集。共发现 4 个发生了差异甲基化、 差异表达且
甲基化变化水平、 表达水平变化趋势相反的基因, qRT-PCR 实验验证了这些基因在两种卵巢癌细胞中的表达水平。
结论 利用生物信息学和分子生物学相结合的方法, 可以筛选出部分影响卵巢癌对顺铂抗药性的基因, 为进一步揭
示其中的分子机制提供实验参考。