天津医药 ›› 2017, Vol. 45 ›› Issue (12): 1289-1292.doi: 10.11958/20170801
翟惠惠 1, 赵洪波 2, 张琴 1, 杨丽华 1△
ZHAI Hui-hui1, ZHAO Hong-bo2, ZHANG Qin1, YANG Li-hua1△
摘要: 摘要: 目的 基于肿瘤基因图谱(TCGA)数据集研究脂肪非典型钙黏蛋白 2(FAT2)基因在卵巢癌中的表达情 况, 预测并分析 FAT2 在卵巢癌发生发展中的可能机制及临床价值。方法 应用 cbioprotal 在线分析平台分析 TCGA 数据库中 311 例上皮性卵巢癌 RNA-SEQ 数据, 并结合患者的完整生存期信息, 采用 Kaplan-Meier 法分析 FAT2 变异与卵巢癌患者生存之间的关系。应用 genecards 数据库收集与 FAT2 基因相关的蛋白, 绘制 FAT2 相关蛋 白网络图, 对相关蛋白进行富集分析, 分析蛋白富集的信号通路、 生理过程及关键下游基因。结果 311 例卵巢癌样 本中有 12 例发生 FAT2 基因变异, 变异率为 4%, 扩增 7 例(2.3%), 错义突变 3 例(1%), 缺失 2 例(0.6%)。Kaplan Meier 生存曲线分析表明, FAT2 变异组总生存时间长于无变异组 (P=0.033 8), 无病生存时间与无变异组差异无统计 学意义 (P=0.387)。与 FAT2 相关的蛋白有 CTNNB1、 ARVCF、 CTNND1 等 21 个, 其中 CTNNB1 蛋白在卵巢癌中低表 达, 相关蛋白富集分析到 Wnt 信号通路、 细胞黏附等细胞生理活动。结论 FAT2 基因可能可通过诱导 Wnt 通路中 的关键蛋白 CTNNB1 降解发挥抑癌基因的作用。卵巢癌组织中 FAT2 高表达是一种预后良好指标, 可作为预测患者 生存时间, 判断预后的有效生物标志物。